Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCHNA4D1U4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms