Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC162PA2VCL2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC162PA2VCL2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms