Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE3A1L190 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms