Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN6Q9Y6Q1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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