Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLIC4Q9Y696 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLIC4Q9Y696 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms