Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms