Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCDHB2Q9Y5E7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms