Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL11Q9Y3B7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL11Q9Y3B7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms