Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms