Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRAPPC8Q9Y2L5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms