Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC48.09■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC48.08■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC48.08■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC48.08■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC48.08■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC48.08■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
NISCHQ9Y2I1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC48.03■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
NISCHQ9Y2I1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC48■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC47.99■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC47.99■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
NISCHQ9Y2I1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
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