Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC5Q9UQL6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC5Q9UQL6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms