Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACAD8Q9UKU7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAD8Q9UKU7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms