Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms