Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APEX2Q9UBZ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms