Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF1Q9UBU9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms