Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DKK2Q9UBU2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms