Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UPB1Q9UBR1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms