Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms