Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms