Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC59Q9P031 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms