Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHMP5Q9NZZ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms