Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A12Q9NXJ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A12Q9NXJ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms