Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CWC25Q9NXE8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms