Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPRSS4Q9NRS4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms