Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSU72Q9NP77 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSU72Q9NP77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms