Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNCQ9H7C4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNCQ9H7C4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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