Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMYD3Q9H7B4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD3Q9H7B4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms