Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTDSP1Q9GZU7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTDSP1Q9GZU7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms