Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms