Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFT27Q9BW83 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFT27Q9BW83 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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