Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KATNB1Q9BVA0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KATNB1Q9BVA0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms