Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms