Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H2AFJQ9BTM1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2AFJQ9BTM1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms