Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NIPSNAP3BQ9BS92 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms