Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms