Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUFY1Q96T51 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms