Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DCLRE1CQ96SD1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms