Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CICQ96RK0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CICQ96RK0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms