Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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