Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms