Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNS1Q96KK3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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KCNS1Q96KK3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNS1Q96KK3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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