Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR1Q96JP9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms