Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC136Q96JN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms