Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM17Q96I25 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM17Q96I25 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms