Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA7LQ96GN5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA7LQ96GN5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms