Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BICD1Q96G01 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms