Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSUN4Q96CB9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSUN4Q96CB9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms