Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TOPBP1Q92547 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms