Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCOLN3Q8TDD5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCOLN3Q8TDD5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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